رهبر جمهوری اسلامی در نخستین پیام خود پس از برقراری آتش‌بس بین ایران و اسرائیل که به جنگ شدید ۱۲ روزهٔ دو کشور پایان داد، ادعا کرد ایران بر اسرائیل و آمریکا «پیروز شده است»، اما سخنی از پذیرش آتش‌بس نگفت و دلیلی برای موافقت خود با آتش‌بس را بیان نکرد.
علی خامنه‌ای که پیام تصویری ضبط‌شدهٔ او از مکانی نامعلوم از تلویزیون جمهوری اسلامی پخش شد، ادعا کرد که اسرائیل «با آن همه هیاهو، با آن همه ادعا، در زیر ضربات جمهوری اسلامی تقریبا از پا درآمد و لِه شد».
او در پیام روز پنج‌شنبه پنجم تیر همچنین مدعی شد که ایران در این جنگ «سیلی محکمی به صورت آمریکا زده است».
او گفت «این پیروزی جای چند تبریک دارد» و در توضیح آن گفت یکی از تبریک‌ها به خاطر دخالت آمریکا در جنگ است که «احساس می‌کرد اگر مداخله نکند، رژیم صهیونی (اسرائیل) کاملا نابود خواهد شد».
رهبر جمهوری اسلامی حمله آمریکا به سه سایت هسته‌ای ایران را «مستحق پیگرد قانونی در دادگاه‌های بین‌المللی» دانست اما گفت «آمریکا هیچ دستاوردی از این جنگ نداشت».
خامنه‌ای به «بزرگ‌نمایی غیرمتعارف» از سوی دونالد ترامپ اشاره کرد و ادعا کرد «هرکسی فهمیده است که حقیقت دیگری در پشت این سخنان وجود دارد».
علی خامنه‌ای در این پیام از دونالد ترامپ شاکی شد که خواهان «تسلیم» ایران شده بود و آن را «یک اهانت» به ملت ایران نامید.
به گفته او، این خواسته آمریکا «یک حقیقت را لو داد» و آن این‌که آمریکا از آغاز جمهوری اسلامی هر بار به «بهانه‌های گوناگون» مانند برنامه موشکی، برنامه هسته‌ای، حقوق زن و غیره خواهان تسلیم ایران بود، اما «تسلیم هرگز اتفاق نخواهد افتاد و ملت ما قدرتمند است».
رهبر جمهوری اسلامی ایران شلیک ۱۴ فروند موشک سپاه پاسداران به پایگاه العدید در قطر در شامگاه دوم تیر را دستاوردی قابل توجه نامید و گفت در صورت تکرار «تجاوز»، این گونه اقدامات ایران ادامه خواهد یافت.
دونالد ترامپ روز چهارم تیر در حاشیه اجلاس ناتو فاش کرد که ایران ساعت و محل حمله تلافی‌جویانه را اعلام کرده و پرسیده بود «آیا ساعت یک (به وقت واشینگتن، برای حمله به العدید) خوب است؟».
قطر که پایگاه العدید آن محل استقرار نیروهای آمریکایی است، آن حمله موشکی ایران را رهگیری کرده و یک موشک از ۱۴ موشک نیز در بیابان فرود آمده بود. پایگاه نیز پیشاپیش از نیروهای آمریکایی و تجهیزات مهم تخلیه شده بود.
علی خامنه‌ای در پیام «پیروزی» خود، از حملات موشکی ایران به خاک اسرائیل تقدیر کرد و گفت این‌که نیروهای مسلح موفق شدند از سد دفاعی چند لایه اسرائیل عبور کرده و «بسیاری از مناطق شهری و نظامی آن‌ها را... با خاک یکسان کنند»، «از بزرگ‌ترین نعمت‌های الهی است».
اسرائیل تأکید دارد تنها ۳۱ فروند موشک از ۵۵۰ موشک شلیک شده ایران در کنار آسیب به مؤسسه علمی وایزمن، آسیب به پالایشگاه حیفا و نیروگاه اشدود، عمدتا به ساختمان‌های مسکونی اسرائیل آسیب وارد کرد و ۲۸ غیرنظامی اسرائیل را کشت.
اسرائیل در پایان ۶۰ روز مهلتی که آمریکا برای دستیابی به توافق با جمهوری اسلامی بر سر برنامه هسته‌ای ایران به تهران داده بود، بامداد ۲۳ خرداد به ایران حمله کرد و با کشتن شمار زیادی از فرماندهان ارشد نظامی و دانشمندان هسته‌ای، اعلام کرد کنترل هوایی ایران را به دست گرفته است.
اسرائیل در روزهای بعد سایت‌های هسته‌ای ایران و صدها مقر نظامی و انتظامی ایران را بمباران کرد.
به دستور دونالد ترامپ، هواپیماهای ب ۲ آمریکا بامداد یکشنبه اول تیر با ۱۴ فروند بمب سنگرشکن فوق سنگین به سایت فردو حمله کردند و همچنین زیردریایی‌های آمریکا از فاصله بیش از ۶۰۰ کیلومتری با شلیک موشک‌های تاماهاک سایت‌های هسته‌ای نطنز و اصفهان را هدف قرار دادند.
یک روز پس از حمله آمریکا در ایران، و ساعاتی پس از آن‌که ایران موشک‌های تلافی‌جویانه را به قطر شلیک کرده بود، دونالد ترامپ در واشینگتن از «مراجعه هم‌زمان اسرائیل و ایران» به او برای پایان دادن به جنگ خبر داد؛ آتش‌بس از ساعت ۷ بامداد روز سه‌شنبه سوم تیر اجرایی شد.
آقای ترامپ در همان روز مانع از حمله دوباره اسرائیل به ایران به دلیل ورود دو موشک ایرانی به آسمان اسرائیل شد و با خشم زیاد اسرائیل را به برگرداندن جنگنده‌هایش که در راه رفتن به ایران بودند، وادار کرد.
خامنه‌ای از آتش‌بس و چرایی آن سخنی نگفت
نخست‌وزیر اسرائیل روز سوم تیر گفت به آتش‌بس متعهد است. اما علی خامنه‌ای در پیام تازه خود اشاره‌ای به پذیرش تعهدات ایران برای آتش‌بس نکرد و همچنین نگفت که چرا خود او با آتش‌بس موافقت کرده است.
او مانند دو پیام دیگر خود در دو هفته اخیر، بارها از عبارات «ملت ایران» و «فرهنگ و تمدن ایران» یاد کرد.
عدم حضور و پیامی از رهبر جمهوری اسلامی در دو روز نخست آتش‌بس، گمانه‌زنی‌هایی را برانگیخته بود. روزنامه نیویورک‌تایمز در میان رسانه‌های جهانی بود که بامداد پنج‌شنبه مقاله‌ای در مورد عدم حضور رهبر جمهوری اسلامی با وجود برقراری آتش‌بس منتشر کرده بود. برخی رسانه‌های دیگر نیز نوشته بودند که او هنوز از احتمال هدف قرار گرفتن از سوی اسرائیل نگران است.
رهبر جمهوری اسلامی از زمان حملات پیشدستانه اسرائیل به ایران در بامداد ۲۳ خرداد به مکانی نامعلوم رفت و در ملاء عام دیده نشد.
او روز ۲۹ خرداد که هفتمین روز درگیری بود، یک پیام دیگر از محل اختفای خود به شکل تصویری منتشر کرد، که دارای کیفیت نبود و کارشناسان آن را نشان حضور او در یک مکان اضطراری و بدون امکانات لازم برای تهیه تصویر مناسب تعبیر کردند.
وزیر دفاع اسرائیل علی خامنه‌ای را پس از اصابت موشک به بیمارستان «سوروکا» در شهر بئرشبع «موجود فانی» نامید و او را تهدید کرد.
دونالد ترامپ گفته بود از محل اختفای «رهبر به اصطلاح معظم» ایران آگاه است اما فعلا از بین بردن او در میان نیست.
